Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ALCAMQ13740 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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