Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2Q13563 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2Q13563 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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