Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HDAC1Q13547 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HDAC1Q13547 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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