Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATMQ13315 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATMQ13315 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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