Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GRIN2BQ13224 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN2BQ13224 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
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