Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DUSP4Q13115 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DUSP4Q13115 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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