Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
STRN3Q13033 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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