Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BNIP1Q12981 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
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