Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NFIAQ12857 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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