Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM27E3Q08E93 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms