Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDE4DQ08499 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms