Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CYP4F3Q08477 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP4F3Q08477 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms