Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TGM3Q08188 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TGM3Q08188 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms