Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC3A1Q07837 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms