Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms