Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL9Q07325 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms