Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
CD164Q04900 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
CD164Q04900 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
CD164Q04900 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
CD164Q04900 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms