Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OTUD4Q01804 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms