Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
FANCCQ00597 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms