Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCL7P80098 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCL7P80098 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL7P80098 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL7P80098 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms