Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RELNP78509 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RELNP78509 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RELNP78509 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RELNP78509 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RELNP78509 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RELNP78509 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RELNP78509 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RELNP78509 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms