Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
HBBP68871 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
HBBP68871 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HBBP68871 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HBBP68871 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms