Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63132 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63132 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms