Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RHBDL3P58872 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms