Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CABP4P57796 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CABP4P57796 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CABP4P57796 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CABP4P57796 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CABP4P57796 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CABP4P57796 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CABP4P57796 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CABP4P57796 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms