Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NUP107P57740 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NUP107P57740 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms