Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CASP9P55211 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CASP9P55211 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP9P55211 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CASP9P55211 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CASP9P55211 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms