Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF1P55201 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms