Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
AQP4P55087 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AQP4P55087 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AQP4P55087 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AQP4P55087 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AQP4P55087 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AQP4P55087 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AQP4P55087 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms