Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP98P52948 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP98P52948 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP98P52948 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP98P52948 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP98P52948 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP98P52948 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP98P52948 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NUP98P52948 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP98P52948 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms