Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PGDP52209 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PGDP52209 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PGDP52209 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PGDP52209 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms