Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GPC3P51654 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GPC3P51654 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms