Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SSR4P51571 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SSR4P51571 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR4P51571 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR4P51571 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms