Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRE11P49959 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRE11P49959 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRE11P49959 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRE11P49959 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
MRE11P49959 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MRE11P49959 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MRE11P49959 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MRE11P49959 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MRE11P49959 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms