Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CLK1P49759 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms