Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ACADSBP45954 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ACADSBP45954 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms