Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NR4A2P43354 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A2P43354 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms