Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
LTBRP36941 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
LTBRP36941 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LTBRP36941 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LTBRP36941 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LTBRP36941 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms