Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD13P35453 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms