Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PCGF2P35227 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PCGF2P35227 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms