Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CTNNB1P35222 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms