Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GJA4P35212 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GJA4P35212 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GJA4P35212 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms