Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
KDM5AP29375 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KDM5AP29375 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms