Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GTF2E2P29084 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms