Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHATP28329 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
CHATP28329 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHATP28329 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHATP28329 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHATP28329 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHATP28329 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CHATP28329 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms