Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DNMT1P26358 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DNMT1P26358 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms