Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTAFRP25105 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTAFRP25105 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms