Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAMP1P23763 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VAMP1P23763 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms