Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPS6KB1P23443 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS6KB1P23443 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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