Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SYT1P21579 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SYT1P21579 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYT1P21579 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYT1P21579 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms